رودخانه زایندهرود از سمت جنوب غربی وارد شهرستان فلاورجان شده و پس از طی مسیری حدود ۲۵ کیلومتر از سمت شمال شرقی خارج میشود. این جریان با عبور خود نقش بسزایی در تعدیل آب و هوای شهرستان دارد. از نظر اقلیمی، شهرستان دارای آب و هوای نیمه بیابانی با تابستانهای گرم و زمستانهای نیمه سرد است.
بالاترین دمای مطلق در دوره ۱۲ ساله (۱۳۵۳ تا ۱۳۶۵) ۴۱+ درجه سانتیگراد گزارش شده است.
کمترین دمای مطلق در همین دوره –۵٫۱۸ درجه سانتیگراد بوده است.
متوسط حداکثر دما طی این دوره ۲۲٫۷+ درجه سانتیگراد بوده است.
متوسط حداقل دما ۶٫۱+ درجه سانتیگراد گزارش شده است.
میانگین دمای سالانه در این دوره ۱۴٫۴+ درجه سانتیگراد است.
متوسط بارندگی ۱۲ ساله در شهرستان ۱۴۲٫۲ میلیمتر گزارش شده است.
بیشترین بارشها در فصل زمستان و اوایل بهار رخ میدهد.
اطلاعات ایستگاههای هواشناسی منطقه، آب و هوا را معتدل همراه با رطوبت نسبی ارزیابی کردهاند. عبور رودخانه زایندهرود از منطقه موجب رونق و حاصلخیزی خاک شده است. عمده بارشها تحت تأثیر جریانهای مدیترانهای است که از سمت غرب وارد میشوند و از اوایل پاییز تا اواسط بهار منطقه را تحت تأثیر قرار میدهند. به دلیل موقعیت جغرافیایی خاص، بخشی از تودههای مرطوب پیش از رسیدن به شهرستان رطوبت خود را از دست میدهند.